Logo ini memadukan elemen dan simbolisasi manusia yang bersinergis dan berkolaborasi (dosen,tendik, mahasiswa) untuk mencapai UNEJ yang unggul dan berdampak yang disimbolisasikan dengan Angka Satu (1) yang lebih tinggi posisinya dibandingkan dengan Angka Enam (6). Disamping itu, Angka Satu memadukan warna biru (warna jaket almamater) yang menunjukkan kampus yang dinamis dan menjadikan visi pertanian industrial sebagai unggulan dan huruf TH dengan warna kuning menunjukkan tahun yang berarti era kejayaan dan masa keemasan UNEJ.

Angka 61 menunjukkan momentum peringatan sejarah perjalanan UNEJ hingga saat ini yang sudah berusia 61 tahun.

Warna biru, hijau, dan kuning keemasan menunjukkan UNEJ yang semakin dinamis dan bervisi pertanian industrial terus tumbuh dan bersinergis dan berkolaborasi sehingga berdampak menjadi kampus bagi generasi yang unggul.